菌叢解析 (QIIME2) を実施します

環境微生物学を専門とする博士課程研究者が対応いたします。 ココナラ開業前に企業様からのご依頼をいただいた経験があります。 本サービスは、研究者・大学院生の方向けに、QIIME2を用いた菌叢解析 (微生物群集構造解析) をサポートするものです。 「シーケンス (FASTQ) データは取得したが、解析環境が整っていない」 「外部委託で得たデータを統一条件で再解析したい」 そのような方におすすめです。 シーケンスRunが異なる場合や、解析条件が統一されていない場合、菌叢の構成比 (相対存在度) の直接比較が困難になることがあります。本サービスでは、生データからQIIME2で再解析を行い、統一条件下での比較が可能なデータを作成します。 ＜標準解析内容＞ 【菌叢構成解析】 ・ASV作成 (DADA2) ・分類群アノテーション ・相対存在度の算出 【α多様性解析】 ・希薄化曲線 ・Shannon指数等の算出 ・群間比較 納品物: ・分類階級ごとの相対存在度データ (エクセルファイル) β多様性解析、統計解析、PICRUSt2による機能予測はオプションにて対応いたします。 ※臨床・個人情報を含むデータはお受けできません。