BioOps Lab

バイオ解析ツールのLinux・Conda環境構築を支援します

現在はITエンジニアとして勤務しています。 過去には約4年間、医学・遺伝子解析に関わる研究環境で、NGS/WGS解析ツールを使用した業務に携わっていました。 Linuxサーバ上でのMiniconda / CondaやApptainerを用いた解析環境構築、ツールの導入・実行経験があります。 使用経験のあるツール例： bcftools / vcftools / GATK / Exomiser / Somalier など ココナラでは、研究者・大学院生などの方向けに、指定されたバイオインフォマティクス系ツールをLinux / WSL環境で実行できる状態に整える技術支援を中心に対応します。 主に対応する内容は、 ・Conda環境の構築 ・依存関係やバージョンの整理 ・指定ツールの実行確認 ・environment.ymlや実行手順の作成 などです。 生物学的な解析手法の選定、解析結果の解釈、病原性・臨床判断などは対応範囲外です。 「使用したいツールや実行条件は決まっているが、環境構築で詰まっている」といったケースの技術面を支援します。