STLファイルのリペア方法についての相談

初めまして。Pythonで3Dモデリングを行っている者です。 skimage.measure.marching_cubes_lewiner を用いて、ボクセル空間からマーチングキューブ法により表面メッシュを作成し、 trimesh.export にてバイナリ形式のSTLファイルとして保存しました（000017.stl）。諸般の都合により、ワザと穴の開いたメッシュを作り、穴を pymeshfix にて塞ごうとしております。 ところが、trimesh.load でSTLファイル（000017.stl）を読み、 meshfix = pymeshfix.MeshFix(vertices, faces) としてpymeshfixオブジェクトへ変換して、meshfix.plot()にて表面メッシュの確認をすると、何らかのエラーを示す「赤線」がメッシュ全面に現れます（Original.png)。この状...