ESN(EchoStateNetwork)の中間層の応答行列を取得したい

理系大学学部生三年生のものです．年末年始のお忙しい中，見積相談失礼します． 現在RNNの一種であるESNの研究を行おうとしています． 研究の主題は，ESNの中間層の構造をいろいろ変えてみてESNの時系列予測タスク等の性能評価を行う，というものです． ESNのプログラムはGitHubから取得したサンプルプログラムを基本にして運用しています． ESNの中間層の構造については，PythonのNetworkxというライブラリを用いて，中間層の構造を表す重み付け行列を作成しています．この中間層の構造をランダムネットワークにしたり，スモールワールドネットワークにしたりして，何通りかの重み行列を取得しています． このサンプルプログラムではランダムネットワークの場合の重み付け行列で構築されており，中間層の応答行列を取得している部分があるのですが，NetworkXで取得した，中間層の構造を表す重み付け行列を使うと上手く応答行列が取得できません． 今回依頼したい内容は 1.Networkxで出力した，中間層のネットワーク構造を表した行列をESNのプログラムに導入して，中間層の応答を行列として出力できるようにする． ということになります． GitHubで得たプログラムの骨格はあるのですが，Pythonの知識が欠けているために上手く運用できていない現状です．どうかお力添えをいただければ幸いです． ESNのプログラムと中間層の構造の行列を作成するプログラムを添付します．