個人の確定申告（配当・利子）の申告方法について

個人の確定申告に関する疑問について、教えていただける方を募集しています。 当方はサラリーマンで、給与所得に加え、特定口座で保有している株式配当を総合課税で申告しています。 しかし、数年前からよく分からずに個人向け国債の利子についても、「利子・配当所得」として、特定口座年間取引報告書を参考にしながら申告しています。 計算上、所得税は還付されているように思うのですが、この申告方法に意味があるのか、また正しい処理なのかが分からず、疑問に感じています。 資料として、当方の確定申告書をお見せすることは可能ですので、仕組みや考え方についてご教示いただける方がいらっしゃいましたら、ぜひお願いしたいです。 よろしくお願いいたします。