土壌の微生物・菌の研究をしたい(2025年の中学生夏休み宿題に向けて)

ちょっと早いですが、来年の中学三年生夏休みの理科自由研究についての取り組みサポートの依頼です。 研究には気温などの条件も関わってくるかと思い、早めに取り組みをスタートしようと考えた次第です。 当方、将来、知り合いの稲作農家さんの米作りの後を継ぎたいと思っている中学生と、その母です。 昨今、化学肥料が高騰していること、また、健康面への配慮からも、その農家さんは納豆菌、乳酸菌、酵母菌等の微生物を使って土壌を元気にする野菜作りを目指していらっしゃいます。 先日、ちょうど、その菌の作り方についての話をされ、中学生の息子が「菌作り、なんだか面白そう！大学で農業を学ぶ前に、自分なりに菌作りのことを研究してみたい　」と言ったので、早くから取り組んで、菌の自由研究を2025年夏休みの宿題として提出したいと思っております。 中学3年生らしいレベルでの実験取り組みなど教えていただけるとうれしいです。 これから気温も下がっていくので、この低い気温ならではの実験もあるのではないかと思っています。 力を貸してくださる方、いらっしゃいましたら、どうぞよろしくお願いいたします。 我が家には理系の人間が1人もおらず、実験や研究論文の書き方についてはまったくの音痴であります。