公開されているRNA seqデータを用いての解析のアドバイス　バイオインフォマティクス

概要：RNA seqのデータ解析を自力で行えるようになる。具体的にはマウス間での発現量変化の比較。 背景：特定のタンパク質の発現量の変化を既存のRNA seqデータから推定したいと考えています。 パソコン環境：Windows10 pro, 64bit, RAM8G, まずはマッピングまででも自力でできるようになりたいと思っています。経験がないため教えて頂ける方を探しています。Ubunts環境で自分でも行ってはみたのですが、エラーが出てしまい詰まります。それがスペックや、versionの問題なのか、コードの誤り、あるいはディレクトリが違うのか自分では判断がつかない状況です。宜しくお願い致します。