輸入消費税の控除（還付）

【概要】 輸送会社名義で輸入してしまった物品について、輸入時に支払った消費税を控除したいので方法を教えてほしい。 【目的】 輸入時に支払った消費税を控除したい。 【適している専門家】 税理士、通関士、特に輸入に関して詳しい税理士 【依頼背景】 当社はアメリカの法人です。現在、日本の倉庫に物品を置くためにアメリカから日本に自社の物品を移動しました。 その際、当該物品の金額に応じて輸入消費税が発生したので支払いました。 なお、当社はアメリカの法人ですが、日本の消費税課税事業者として登録しており、消費税の申告をしております。 （原則課税方式で登録しているため仕入税額控除が可能です。） 今般、問題としては、自社の所有物であるにも関わらず、輸入許可通知書上では、輸送会社（乙仲、フォワーダー）の名義で日本に輸入してしまいました。 当社は輸送会社が当該輸入消費税の請求をしてきたので、当該輸入消費税を支払ったのですが、この輸入消費税は当社の名義で仕入税額控除できますか。 その場合、どのようにしたらよろしいでしょうか。 【特に知りたい点】 ①既に輸入した物について、輸入許可通知書を修正しなければならないのかどうか。 ②もし①がYesの場合、上記①は現実的に可能なのかどうか。どのようにしたら可能なのか。 　また、どのように控除できるのか。通常の消費税申告に入れて良いのか。 ③もし①がNoの場合、どのように控除できるのか。通常の消費税申告に入れて良いのか。 【提案の際のお願い】 過去にこのような実績があるかなど教えていただけると幸いです。 また、手順を１から詳しく細かく教えていただける方だとありがたいです。