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バイオインフォマティクスについて詳しい方にご質問です
用途・種類
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依頼工程
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開発言語
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募集内容
募集内容
バイオインフォマティクスについて学習中のものです。
Macを利用していますが理解不足のためよくわからない部分が多いです。
具体的な質問はその都度させていただきます。
よろしくお願いします。
添付ファイル
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求めるスキル
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特記事項
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応募者一覧
応募者
応募日時
募集内容についての質問
質問と回答の履歴
nyaao40
3年以上前
BioCondaについて少し漁ってみましたが、言葉の意味がわからないと厳しいですね。
都度説明頂ければある程度フォローできるかと思いますが、ご依頼の趣旨とは異なるように思います。
理解不足の主なところがPythonに係るのであればお手伝いできそうですが…
お力添えできそうもありません。
desertfox
3年以上前
ありがとうございます。
それではSRA Toolkitのインストールとfasterq-dumpﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑの実行はどうでしょうか。
自分の環境だと教科書の通りになりません。
そこで引っかかっています。
nyaao40
3年以上前
化学出身でpythonなどのデータ分析ツールにも素養があります。バイオではないのですが、ケモインフォマティクス的なことにも取り組んだこと経験も。
お手伝いできそうでしょうか。
desertfox
3年以上前
ご回答ありがとうございます。
バイオインフォマティクスの教科書にのっているツールを利用しています。
BioCondaを主に利用しているようです。
今つまずいているのはトランスクリプトーム解析というものでsalmonコマンドによる発現定量解析の方法です。
この辺はいかがでしょうか。
募集終了
予算
2,000円
