開業届にかんして

開業届をフリー開業を介して申請しようと思ってました。 私はネットショップを複数店舗持っているのですがその際の申請方法はどのようになるのでしょうか？ ネットショップの数分開業届を何回も申請するのでしょうか？ 開業や税務に関して詳しい方を探しております。