レイアウトの崩れの原因特定と修正

【概要】 当方オンラインストアの表示が崩れており、原因の特定を修正作業をお願いいたします。 【サイト環境】 サイトのショッピングカートはカラーミーを利用しています。全体のトップページ、ブランドごとのトップページ、会社概要といった一部のページは外部CSSで制御しています。サーバーはヘテムルを利用しています。 【表示崩れの経緯】 2020年8月は正常に表示されていました。 9月からヘテムル新サーバー環境への移設メンテナンスが告知されていましたが、弊社で事前に対応をしなかったため、9月に入るとトップページや会社概要などのカラーミー外のページが404エラーになりました。 ヘテムルカスタマーサポートの指示に従い、古いAddHandlerの記述削除とPHPバージョン更新（5.3→5.6）を実施。ページの表示はされるように改善しましたが、レイアウト崩れは継続して存在しました。 この後、更新後PHPバージョンに対応したAddHandlerの記述を追加することでレイアウト崩れは解消しました。 しかし、ヘテムルの移設先フォルダの内容が1年前のものになっていたため、サイトの画像などが古いものに変わってしまっていました。これについては移設先フォルダに最新のファイル類をアップロードすることで解決し、これをもって8月時点の正常なサイト状態に復帰させることができました。 上記から数日後、ふたたびトップページのレイアウトが崩れました（この間、作業はしていないにもかかわらず）。カラーミーページにおいても共通部分の表示がおかしく、またスクロールもできない状態です。 グーグルクロームのデベロッパーツールでエラー箇所は確認できるが、画面をリフレッシュする度にエラーの数が変わります。 トップページはブラウザ、またはタイミングによって正常に表示されることがあるが、カラーミー内ページの表示崩れとスクロール機能不全は常にある状態。 当方においてはCSSなどサイトの動作や見栄えを担うファイルは全く触れておらず、ヘテムルにおけるサーバー移設に伴う環境変更に原因があるとしか考えられず、ヘテムルに何度も問い合わせていますが、解決に至っていない状況です。