背景透過の動画保存方法をわかりやすく教えてください

はじめまして。 背景透過の状態で動画を保存する方法を詳しく教えていただける方を探しています。 添付の 走っている映像の後にキャラが出てきてパンチして画面を割る動画の後半部分のように、背景を透過したまま保存したいです。 Catnapを使用し、グリーンバック透過後に保存しましたが、透過部分が黒くなり透過されません ハードはiPhoneもしくはiPadでございます