■サービス内容
【背景】
分子シミュレーション(以下、分子SM)は、分子を時々刻々と動かすことでミクロレベルの現象をコンピュータ内で再現できる便利な計算手法であり、下記のような幅広い分野の基礎研究で用いられております: ・バイオ(タンパク質、脂質、DNA/RNA、創薬 等) ・材料(ゴム、繊維、プラスチック、カーボンナノチューブ 等) ・化学物質(香料、食品 等) ・基礎物質(水、空気 等) ※再現できるシステムに時空間的な制約はございます。
【現状の課題】
このように応用先が多岐に渡る分子SMですが、実施するために、熱力学、統計力学、解析力学等の科学知識が必要となる、また計算量が膨大となるため高度な計算科学の知識が必要となることから、個人・企業含め、容易に取り組めない現状がございます。
【本サービスのご提案】
本サービスは、分子SMを専門とし後期博士課程を修了した筆者が、安価で分子SMを請け負うサービスとなります。 委託レベルは分子SM実行~分析まで全て任せていただくところから、分子SM実施のFeasibilityご相談のみ、あるいは分子SMデータの納品まで等、随時ご対応いたします。
■料金内訳
【相談費(コンサルフィー含む)】
3~5万円程度 分子SMを流すにあたって、お客様の背景、ご要望、計算システムを明確化するため、事前のご相談を綿密に行います。また分子SMの実施に向け、構造データの確認、必要な科学考察を行うためのシミュレーション長さ等の検討を行い、統計力学的、熱力学的観点から流す想定の分子SMが妥当であるか、検討いたします。
【計算資源確保費】
30~50万円程度(AWSにてGPUサーバを構築した場合を想定) 分子SMは多くの計算資源を必要といたします。GPUサーバにて1ヶ月程度の分子SMが必要となる場合が多く、その場合のクラウドPC利用料金となります。
【データ整理、分析、解析作業費】
15~30万程度 シミュレーションデータ自体も納品いたしますが、シミュレーションデータだけもらっても分析、解釈できない方々は、分析、解析作業についても、しっかりと実施させていただきます。また、分析基盤構築のご支援も承ります。
【その他】
工数・ボリュームに合わせてお見積もりさせていただきます。 ご予算、納期など、随時ご相談応じます。
○高額・長期サービスとなりますので、お客様の背景や利用目的について、ヒアリングを通して十分理解した上で、分子SMを実施いたします。
○ヒアリングを通して、分子SMの実施が不可と判断する場合もございますのでご了承ください(その場合、料金はいただきませんが、事前周辺調査費として5,000円負担いただきます)。 実施不可の例)分析対象現象の空間スケールが大きすぎる、時間スケールが長すぎる、分子構造が無い 等
○内容に依りますが、概ね以下のスケジュール・費用で進めさせていただきます:
(発注1:事前周辺調査、ヒアリングのみ):5,000円
・事前周辺調査、ヒアリング:1週間程度
(発注2:分子MD全体、分割発注可):500,000円~
・分子SM前相談、コンサル:2週間程度
・分子SM準備:3週間程度
・分子SM実施:1ヶ月
・データ解析、結果報告:2週間